Hiromasa Yonebayashi, directora de Arrietty y When Marnie Was There, ahora da vida a un deslumbrante trabajo de entretenimiento animado, que ofrece todo lo que ha aprendido durante casi veinte años en Studio Ghibli. Mary se ha mudado a Redmanor Village. En un bosque cercano, encuentra una misteriosa flor llamada «Fly-by-Night» que solo florece una vez en siete años. También se le llama la «flor de la hechicera» prohibida. Al adquirir poderes mágicos que duran solo una noche, a Mary se le permite ingresar a Endor College, la mejor institución educativa del mundo mágico, que se eleva sobre un mar de nubes. Sin embargo, una mentira de Mary hace que un grave incidente caiga sobre alguien que le importa. La directora de Endor College, Madam Mumblechook, busca la Flor de la Bruja y El científico de magia de Endor College, el doctor Dee, conduce extraños experimentos. Mary se encuentra con una misteriosa hechicera pelirroja y un niño llamado Pedro que se harán parte de la aventura. Mary encuentra una manera de escapar de la tierra de las hechiceras perdiendo así todos sus poderes mágicos y la verdad sobre la «Flor de la hechicera» se revela gradualmente mientras Mary se queda con una simple escoba y una sola promesa que ha hecho. En un mundo lleno de magia, ¿cuál es el atisbo de esperanza que Mary, una niña humana impotente, encuentra más allá de la oscuridad? Este verano Mary encuentra Sorpresas y alegría … errores y destino … y un poco de coraje. Una película de hechiceras completamente nueva que conmoverá los corazones de cada generación.